Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
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Pdzrn3Q69ZS0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Pdzrn3Q69ZS0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Pdzrn3Q69ZS0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Pdzrn3Q69ZS0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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