Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Sh3rf1Q69ZI1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sh3rf1Q69ZI1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sh3rf1Q69ZI1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3rf1Q69ZI1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sh3rf1Q69ZI1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sh3rf1Q69ZI1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms