Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms