Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf2Q64705 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms