Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn3Q64691 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Capn3Q64691 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn3Q64691 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms