Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Abcg1Q64343 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Abcg1Q64343 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms