Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trim24Q64127 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Trim24Q64127 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim24Q64127 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trim24Q64127 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim24Q64127 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms