Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms