Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcncQ62447 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcncQ62447 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcncQ62447 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcncQ62447 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcncQ62447 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms