Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms