Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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Sema3cQ62181 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Sema3cQ62181 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Sema3cQ62181 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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