Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Sema3bQ62177 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms