Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms