Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phox2aQ62066 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phox2aQ62066 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phox2aQ62066 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phox2aQ62066 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phox2aQ62066 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phox2aQ62066 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phox2aQ62066 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Phox2aQ62066 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phox2aQ62066 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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