Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms