Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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