Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tfap2bQ61313 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms