Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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