Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms