Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms