Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkiQ60698 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkiQ60698 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkiQ60698 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkiQ60698 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkiQ60698 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms