Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms