Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc1Q60596 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms