Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms