Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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