Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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