Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms