Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms