Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap44Q5SSM3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms