Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TefmQ5SSK3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms