Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms