Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS90

Gm11992, Uncharacterized protein C7orf57 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11992Q5SS90 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm11992Q5SS90 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11992Q5SS90 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11992Q5SS90 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11992Q5SS90 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11992Q5SS90 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11992Q5SS90 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11992Q5SS90 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11992Q5SS90 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms