Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PkdccQ5RJI4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms