Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav8d-2Q5R1B6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms