Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm3558Q5FWC9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm3558Q5FWC9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm3558Q5FWC9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm3558Q5FWC9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3558Q5FWC9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm3558Q5FWC9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm3558Q5FWC9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm3558Q5FWC9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm3558Q5FWC9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3558Q5FWC9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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