Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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