Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E7

Zc3h12a, Endoribonuclease ZC3H12A, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12aQ5D1E7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h12aQ5D1E7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms