Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WhammQ571B6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WhammQ571B6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms