Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms