Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc47Q505F5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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