Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otol1Q4ZJM7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otol1Q4ZJM7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otol1Q4ZJM7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otol1Q4ZJM7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otol1Q4ZJM7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otol1Q4ZJM7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otol1Q4ZJM7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otol1Q4ZJM7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otol1Q4ZJM7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otol1Q4ZJM7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otol1Q4ZJM7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otol1Q4ZJM7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otol1Q4ZJM7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otol1Q4ZJM7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Otol1Q4ZJM7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Otol1Q4ZJM7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms