Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Snx33Q4VAA7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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