Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms