Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms