Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms