Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Carmil2Q3V3V9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Carmil2Q3V3V9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Carmil2Q3V3V9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Carmil2Q3V3V9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Carmil2Q3V3V9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Carmil2Q3V3V9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Carmil2Q3V3V9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Carmil2Q3V3V9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Carmil2Q3V3V9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Carmil2Q3V3V9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Carmil2Q3V3V9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms