Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3V0E1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3V0E1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3V0E1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3V0E1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3V0E1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3V0E1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3V0E1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3V0E1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3V0E1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3V0E1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3V0E1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3V0E1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3V0E1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3V0E1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms