Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms