Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm6Q3UZD5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms