Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pfdn4Q3UWL8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pfdn4Q3UWL8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pfdn4Q3UWL8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pfdn4Q3UWL8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pfdn4Q3UWL8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pfdn4Q3UWL8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pfdn4Q3UWL8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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